Самый скоростной, но самый дорогой по стоимости перевозки грузов и пассажиров. Авиационный транспорт представлен в крае АО «Авиационные линии Кубани». Наиболее крупные аэропорты края: Краснодарский, Адлерский, Анапский. Через них осуществляется связь с регионами России и зарубежными государствами Европы и Азии. Годовой пассажирооборот превышает миллион человек.

Сельскохозяйственная авиация проводит работы по мелиорации почв, тушению лесных пожаров.

Леса занимают 22,5% территории края. В результате антропогенного воздействия состояние растительного мира края оценивается как критическое. Практически уничтожены степные сообщества, нарушена растительность горных лесов, альпийских и субальпийских лугов. Исчезают уникальные растительные сообщества и редкие виды растений. Растет количество незаконных рубок леса. В связи с изменением геополитического положения края получила развитие практика изъятия земель лесного фонда для различных хозяйственных нужд. Ухудшается общее санитарное состояние лесов края. Большой вред наносят пожары. Технология лесозаготовок с помощью трелевочных тракторов приводит к развитию эрозионных процессов и деградации почв.

В Краснодарском крае нарушенных земель более 3000 га. В основном это земли, на которых расположены сельскохозяйственные предприятия, предприятия промышленности стройматериалов, железные дороги. Однако рекультивировано гораздо меньше земель, чем нарушено. Почвы края значительно загрязнены тяжелыми металлами (особенно вдоль автострад), пестицидами, которые убивают полезные микроорганизмы и уменьшают плодородие кубанских черноземов. Остро стоит на Кубани и вопрос о загрязнении почв нефтепродуктами, производственными отходами, бытовым мусором и т.п. По данным геоэкологической съемки г. Краснодара, в пределах города и на окружающих территориях в почвах выявлены свинец, цинк, ванадий, кадмий, мышьяк, никель, молибден, медь, сурьма, хром, ...