Продукция животноводства перерабатывается на 20 предприятиях. Среди них мясокомбинаты, птицекомбинаты, мясоптицекомбинаты, хладобойни. Они размещаются в Краснодаре, Армавире, Кропоткине, Сочи, Тихорецке, Тимашевске и других городах. Известен своей продукцией Выселковский агрокомплекс, на балансе которого находятся 4 предприятия по выращиванию и переработке мяса птицы. Среди них Кореновская птицефабрика, Усть-Лабинская птицефабрика «Кубань», которая перерабатывает 15 — 20 т мяса в день. В 2000 г. она переработала 4000 т мяса птицы.

Разнообразна продукция рыбоперерабатывающих предприятий. Переработка рыбы осуществляется на предприятиях Ейска, Приморско-Ахтарска, Темрюка и других. Предприятия объединения «Краснодаррыба» вырабатывают более 60 видов продукции, в том числе консервы, пресервы, икру, рыбные пасты, рулеты.

Сахарная промышленность края представлена 16-ю сахарными заводами. Самые крупные из них — Тимашевский, Тбилисский, Усть-Лабинский, Кореновский.
Переработка плодов и овощей осуществляется на Крымском, Лабинском, Ейском, Курганинском, Абинском и некоторых других предприятиях. Основная продукция этих предприятий — фруктовые, овощные, томатные консервы.

Молочная и молочно-консервная промышленность занимают третье место среди других отраслей пищевой промышленности по валовой продукции и перерабатывают более 53% валового производства молока в стране.
Предприятия молочной промышленности: молочные заводы и комбинаты, маслодельные заводы, молочно-консервные комбинаты, маслодельно-сыродельные заводы и маслосырзаводы — производят более 2000 наименований продуктов. К числу крупных молкомбинатов относятся Краснодарский, Армавирский, Анапский, Сочинский, Тимашевский. Среди молочно-консервных комбинатов выделяют Кореновский и Брюховецкий. Крупнейшие сыркомбинаты — Тихорецкий и Калининский.

Переработка подсолнечника осуществляется маслобойно-жировыми предприятиями Краснодара, Армавира, Кропоткина. Кроме подсолнечного масла, здесь вырабатывают майонез, маргарин и другие виды продукции.